孢子虫病的治疗取决于疾病的严重程度和位置。以下是此病的治疗选择：

1、口服碘化钾  

碘化钾是一种抗真菌药物，被广泛用作皮肤孢子囊病的治疗方法。尽管使用广泛，但尚无高质量的证据支持或反对这种做法。需要进一步的研究来评估口服碘化钾治疗孢子体增生的疗效和安全性。

伊曲康唑（Sporanox）和氟康唑  

这些是抗真菌药。伊曲康唑目前是首选药物，并且比氟康唑有效得多。氟康唑应保留给不能耐受伊曲康唑的患者。  

2、两性霉素B  

该抗真菌药物通过静脉内输送。但是，由于两性霉素B发热，恶心和呕吐的潜在副作用，因此许多患者无法耐受。  

通常建议使用两性霉素B的脂质制剂代替两性霉素B脱氧胆酸盐，因为它具有更好的不良反应。两性霉素B可用于怀孕期间的严重感染。对于患有传播性或严重疾病的儿童，可以先使用两性霉素B脱氧胆酸盐，然后再使用伊曲康唑。

如果发生孢子体增生性脑膜炎，可以给患者服用两性霉素B和5-氟胞嘧啶/氟胞嘧啶的组合。  

3、特比萘芬  

特比萘芬每天500mg和1000mg的剂量持续12到24周已被用于治疗皮肤孢子囊病。  

4、新型三唑  

几项研究表明，泊沙康唑的体外活性类似于两性霉素B和伊曲康唑。因此，它显示出作为替代疗法的希望。但是，伏立康唑的药敏性有所不同。由于尚未证明体外数据与临床反应之间的相关性，因此目前没有足够的证据推荐使用泊沙康唑或伏立康唑治疗孢子体增生。

5、手术  

如果出现骨感染和肺部空洞结节，则可能需要进行手术。  

6、热疗  

热量会产生较高的组织温度，这可能会抑制真菌的生长，而免疫系统会抵消感染。用于该目的的“口袋加热器”具有能够在皮肤表面上保持44℃至45℃的恒定温度数小时的优点，同时允许不受限制的移动自由度。治疗的持续时间取决于病变的类型，位置，深度和大小。通常，每天局部使用1-2小时或在睡眠时间进行5-6周就足够了。